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Spike2 程序


实验

播放ECG R波形检测铃声
ECGTone.s2s (17年1月)

ECGTone.zip

如果取样期间检测到ECG组合的R波,这个脚本会从1401的DAC 0发出’哔哔’的铃声。

取样通过脚本工具栏控制,脚本会让用户设置要监视的ECG信道和R波峰值检测的滞后值,然后用水平光标设置R波检测的阀值。每次超过阀值,脚本都会监测进入数据的水平,并在发现峰值后等待数据下降, 幅度至少达到滞后值设定的水平,然后才播放铃声,表示检测到R波形。

这个脚本要求Spike2 v6.00或更高版本。

力反馈显示
BarDisplay.s2s (08年9月)

BarDisplay.zip

这个脚本是在单独的窗口中显示在线信道值、用于力反馈实验的例子。脚本包含一个空闲例行程序,会根据信道1进入的波形数据更新工具栏显示。

这个脚本要求Spike2 v4.24或更高版本。

用脉冲分析法分析蟋蟀鸣声
SongAn.s2s (17年1月)

songan.zip

用Spike2的脉冲分析功能将蟋蟀鸣声分析为脉冲信号。提供简单的结果数据表。运行前请先打开并显示您的蟋蟀鸣声数据文件。

心动电位分析
Capas.s2s (09年3月)

capas.zip

该程序从心动电位 (CAP) 数据中析取特定参数。

首先要求用户选择一个合适的文件进行分析并确定CAP信道。然后需要在数据文件上放置一个水平游标,让它穿过数据文件的所有上行线。

这样程序每次找到CAP时就能在临时事件信道上进行标记。随后程序从CAP中析取特定的参数;这些数值将在屏幕上显示。

析取的特征包括:

  • CAP 起始时间
  • CAP 结束时间
  • 基准值
  • 峰值
  • 峰值时间
  • 上行梯度
  • 再极化梯度
  • 30, 50, 60, 90% 再极化时间

用户可以在文本窗口中点击鼠标,在数据上放置游标,点击位置指示其数值(说起来麻烦,做起来很简单)。

所需的结果都被转储为文本文件。

呼吸性窦性心率失常
RSA3.S2S (17年1月)

rsa3.zip

该程序设计用于显示EMG数据中的呼吸性窦性心率失常信号。

程序加载数据文件,其中有一个信道的EMG活动数据和一个信道的压力波形数据。对压力信道设定一个阈值水平,对每个压力波形的起点和终点进行标记。 对每个压力波形间隔,按预先设定的频率对瞬时心率采样,并将瞬时频率数据写入文本文件。

眼球运动监视器
EYEMOVE.S2S (03年2月)

eyemove.zip

该程序允许用户绘制二维眼球运动图,并用图形显示眼球固定位置及快速扫视运动 。

每项试验由一系列测试组成,受验者接受视觉刺激,用合适的仪器跟踪其眼球运动。该仪器应该输出两个电压,分别与X和Y 方向上的角度偏移量成正比,这些再作为输入信号送至CED 1401,运行该程序的PC 机上连接1401设备。测试开始时,程序实时显示受验者眼球运动的XY坐标图。随着跟踪进展,可以对眼球固定位置作出标记, 并在测试结束时绘制快速扫描运动图。与这些特征有关的数据记录在日志文件中。

带一个简单的音序器文件eyemove.pls,它向视觉激励仪器发出数字输出信号,触发所需的测试类型。

提供结果扫描和数据离线转储功能。

该程序要求使用 Power1401、1401plus 或micro1401;不能在标准1401 上运行。它仅适用于Spike2 的 3.xx 版本,不能与第2版程序配合使用。

眼睛运动的X-Y平面绘图
I_track.s2s (09年2月)

ltrack.zip

这个离线脚本通过重播数据文件显示眼睛随着一个被跟踪目标的运动并在X-Y视图绘制每只眼的角坐标。

原始数据是眼睛和(可选的)目标运动的水平和数值分量的时间视图,就如所记录的学生追踪摄像机系统一样。这个脚本允许你重播数据同时同步显示跟随眼睛和物体的X-Y轴数据。 你可以在实际速率的0.1x到10x的范围选择重播的速率,并且选择显示数据的时间长度。典型地,你可以选择显示最近重播的数据,例如最近0.5秒的数据。

该脚本需要Spike2版本6.09或更高版本支持。

完整的用户手册包含在脚本文件的评论部分。

.zip文件中包含实例数字文件,可用来试验脚本。

Skinner box
SKINNER BOX.S2S (04年1月)

Skinner.zip

这个程序允许你在Skinner box(斯金纳箱)中的老鼠学会按杠杆的同时记录下一个以上心理数据的信道。每次按杠杆的时间被记录为事件(在端口0和1上), 1401会产生TTL输出脉冲,在老鼠做出符合要求的反应时释放一个食物球。奖励的时间记录在事件端口2上。你可以在一次奖励之后设置一个不应期,即使老鼠按中正确的杠杆也不给与奖励。

提供三个试验性范例:

  1. 按两个杠杆中的任何一个均可获得奖品(训练)。
  2. 按左边的杠杆可获得奖品。
  3. 反向学习。按左边的杠杆可获得若干次的奖励,然后只有按右边的杠杆才能获得奖励。
软件要求:Spike2第3版或更高。
硬件要求:
标准的1401适合用来按高取样率(10k到20kHz)记录单一信道的心理数据。
10kHz或更高取样率的多信道记录要求每个信道配置一个1401plus Micro1401或Power 1401。

创建复杂波形
Chirpetc.S2S (24年2月) 改进!

chirp.zip

T该听觉刺激和录音脚本让您可以:

  • 创建复杂的波形,例如啁啾、斜坡、啁啾/斜坡组合、突发噪音、突发音调和刺激序列。
  • 将多个波形加入采样配置,然后在采样期间,通过 1401 DAC 输出,将它们作为听觉刺激播放。
  • 采样配置中可加载多达 20 个不同的刺激(受 1401 内存限制),以在多个刺激间轻松切换。
  • 按下播放波形条上的按钮触发单次播放刺激,或按下由脚本控制的顺序播放刺激。
  • 以固定间隔重复播放刺激,在两个固定间隔间严格交替或随机交替播放,或在定义范围内以随机间隔播放刺激。
  • 控制 CED3505 可编程衰减器。
  • 记录对这些听觉刺激的生理反应,并以触发扫描或滚动模式显示。
  • 使用采样配置示例,Chirp eg.s2cx,进行测试。
  • ToneCal 脚本(内含)会辅助刺激强度的校准。

硬件要求:

  • Power 1401、Micro1401 mkII、Micro3 或 Micro4(±5V 范围内)。
  • CED3505 可编程衰减器(如需要对刺激强度进行脚本控制)。
  • 一个合适的音频放大器和扬声器或耳机。

这个脚本要求Spike2 v8.25或更高版本。

听觉刺激与单一神经元记录
AudioStimRecSU v705c.s2s (20年8月)

AudioStimRecSU.zip

这个脚本的封装允许你在一个或两个通道上生成声学的和/或振动的激励,记录神经系统的单个单元的响应,并对窗函数鉴别的尖峰执行在线分析。 这些程序以前是为了研究鱼类的听觉系统和侧线器官而开发的,不过应该也适合对脊椎动物和昆虫的各种听觉研究。

使用这个程序包,你可以生成已知强度的声学或振动刺激,记录对这些刺激的细胞内或细胞外单一神经元反应。可用的刺激包括短音和均匀或不均匀猝发音,频率在1Hz到10kHz之间。此外还可以用保存的任意波形(例如预先录制的声音)进行刺激,或触发一个外部刺激器。 记录系统包括一个用于尖峰检测的虚拟窗口辨别器。该脚本还可以生成在一定频率和强度范围内的预定序列的激励,用于快速自动收集生成阈值响应曲线所需的响应。

输入数据的在线分析包括刺激后时间、间隙和状态柱状图。 程序采用循环统计法来量化尖峰对刺激波形的锁相程度。 详细情况请参见用户指南。

系统要求:

硬件:Micro1401 MK2版或更高版本. CED3505衰减器
软件: Spike2 v7.11或以上
脚本: AudioStimRecSU.s2s, SoundCalSU 703.s2s
取样配置: SU.s2c
序列器: SU4.pls
其他文件: MScaldataSU.txt, SpkcaldataSU.txt, SUSettings.txt
用户指南: AudioStimRec SU.pdf, SoundCalSU.pdf, 3505_V2spec.pdf

简单的听性脑干反应
fishabr v1.20.s2s (20年10月)

fish abr release.zip

这套Spike2程序包适合用于记录对短音刺激的听性脑干反应(ABR)。这个程序包以前是为了研究鱼类对水下声音的反应而开发的,不过对于研究其他脊椎动物对空气传播的声音的反应可能同样有用。

这个程序会通过DACO生成含线性升降状态和充满5Hz到10kHz载频的均匀短音。用户可以设置短音的形式、选择极性(或挑选交变极性)、刺激重复率以及平均值包含的扫描数目。刺激强度可以用CED程序控制的衰减器设置为75dB范围内,每5dB为一级。自动应用校准曲线纠正刺激频率强度的变化。

通过ADCO记录的放大前的神经反应通过信号求平均值进行处理。各个刺激频率的平均反应按刺激强度的降序显示,以方便估计临界值。程序在实验进行的同时形成并显示临界值反应曲线。

系统要求:

硬件: Power1401或Micro1401 Mk2. CED3505衰减器
软件: Spike2 v8.00或以上
脚本: FishABR v1.20.s2s, SoundCalSU v703.s2s
取样配置: Fishabr v1.15.s2cx, SU.s2cx
序列器: Fishabr v1.15a.pls, SU7.pls
其他文件: MScaldataSU_0.txt, SpkcaldataSU_0.txt, abrsettings.txt
用户指南: Fishabr v1.16.pdf, SoundCalSU7.pdf

使用 PSF、PSTH 和 CUSUM 研究运动神经元活动
PSF 03e.s2s (18年4月)

psf.zip

外周刺激频率图 (PSF)、外周刺激时间直方图 (PSTH) 及累计图可用于研究运动神经元突触输入的时间过程。该方法包括在重复刺激感觉神经以产生运动神经元突触输入的同时,通过植入肌肉中的电极记录单个运动单位的活动。

提供一个标记运动单位的 Event、Marker 或 WaveMark 通道和一个标记感官输入刺激的 Event 通道,该脚本允许您在线或离线生成 PSTH 图、累计图和 PSF 图。您还可以为了进行演示,重新运行现有的数据文件以模拟在线记录。

该脚本包含详细的用户指南和相关文章的参考列表。

该脚本需要使用 Spike2 版本 8.13a 或更高版本。

分析对移动正弦光栅的视觉响应。
AR 05.s2s (20年8月)

AR05 release.zip

视觉系统中对运动敏感神经元的研究,通常涉及对以不同角度移动的正弦光栅的响应的分析。与 Ribic 实验室(弗吉尼亚大学心理学系)合作,我们开发了使用 PsychToolbox 进行视觉刺激以及使用 Spike2 进行记录和分析的组合,以分析多细胞记录中的运动敏感单元。结果采用平均神经元反应与刺激角度的 PSTH 图和 XY 图的形式。

该程序包:

  1. 指定了所需的硬件
  2. 提供了 Matlab 脚本来产生刺激
  3. 提供了一种用于数据分析的 Spike2 脚本
  4. 提供了一个示例数据文件,方便您熟悉该方法。

该脚本需要使用 Spike2 v9.11 或更高版本。

上面部分程序不是CED的成果,而是用户自己编写的。 如果您也写有程序,希望通过这个网页与大家分享,请告诉Simon Gray。 我们还提供了一些Signal 专用程序。

这些脚本储存为WinZip文件、myscript.zip, 显示为spike\scripts\myscript.s2s的地方除外。 这些文件与Spike2一起安装。spike代表你安装Spike2的目录。点击下面的描述行可以查看概要。然后你可以通过点击文件名开始下载;请检查收到的文件大小。

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