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Scripts para o Spike2


Controlo

Controlar uma interface de pesquisa de telemetria
TR Control.s2s (05/10)

TR Control.zip

Este script e a sequência associada são um exemplo de interação com uma interface de Pesquisa de Telemetria. O script cria uma barra de ferramentas que permite ao usuário controlar a amostragem e definir a duração dos períodos de registro e intervalos.

A saída digital 0 do 1401 deve ser conectada à entrada do acionador do transmissor de pesquisa de telemetria e DAC 0 conectado à entrada de seleção de canal externo para selecionar um canal entre 1 e 12. O sinal que você deseja amostrar deve então ser conectado ao ADC 0 .

Este script requer Spike2 v5.17 ou superior.

Controlar um estimulador Digitimer DS5
DS5Control.s2s (01/17)

DS5Control.zip

Este script e a sequência associada são um exemplo do uso de uma saída DAC do 1401 para controlar um estimulador de corrente constante bipolar isolada Digitimer DS5 e atualizar as configurações durante a amostragem.

Este script requer Spike2 v6.14 ou superior.

Associative learning in mice
Lick 02.S2S (09/24) Novo!

Lick 02.zip

This online script is intended for training a laboratory animal to respond to a stimulus by providing a reward when the desired behaviour is elicited within a specified time window. The script triggers the test stimulus at random intervals, records the behaviour and triggers reward delivery when the required criteria are met. The script also generates counts and plots vs. time of: "hits", "misses", "false positives" and "rejections" (where a rejection is a lack of response in random time windows between stimuli.

Specifically, the script is designed for studies of the type described by Paricio-Montecinos et al (2020). Here the stimulus is innocuous warming or cooling of the glabrous skin of a thirsty mouse's forepaw. The behaviour monitored is licking the spout of a water bottle and the reward is water, only delivered in response to licks during the thermal stimulus. Such studies aim to investigate perceptual thresholds and peripheral and central neural mechanisms of thermo-sensitivity.

The script might, with small modifications, also be useful for other learning or Go/No Go studies that involve different stimuli, behaviour and rewards, e.g. visual cues eliciting lever presses for a food reward.

Reference: Paricio-Montecinos et al. Sensory Coding of Warm Perception, Neuron 106, 830–841 (2020)

Requirements:
Hardware - Micro 1401 MkII or higher (plus appropriate hardware to generate the stimulus and provide the reward when triggered).

Software - Spike2 v9.19 or higher

Calibrar a captura da forma de onda
CALIB.S2S (01/17)

calib.zip

Este script permite ao usuário calibrar a escala e o deslocamento dos canais de forma de onda em uma configuração de amostragem. Primeiro crie uma configuração de amostragem (ou carregue em uma anterior) e, em seguida, execute o script. Você pode amostrar dados em um arquivo de dados temporário. Ao amostrar esses dados, você deve fazer com que a forma de onda que deseja calibrar permaneça em dois níveis conhecidos distintos por um curto período de tempo.

Você pode então pressionar o botão "Calibrar". Isso permite que você selecione as seções de dois níveis dos dados da forma de onda em um canal e especifique quais valores DEVEM ser. O script irá então alterar a escala do canal e deslocamento na configuração de amostragem para atingir esses valores.

Gere pulsos emparelhados e analise os resultados
PPULSE.S2S (01/17)

ppulse.zip

O script PPulse envia pulsos emparelhados através das saídas digitais 0 e 1. O tempo entre os pulsos (o tempo entre estímulos) é escolhido aleatoriamente a partir de uma lista de possíveis valores mantidos em um arquivo de texto estipulado.

Para executar este script, certifique-se de ter os arquivos do sequenciador PPulse1, PPulse2 e PPulse3 no mesmo diretório do script PPulse. Você também deve ter neste diretório um arquivo de texto contendo os ISI's a serem usados (um arquivo de texto de exemplo chamado ISITimes é fornecido).

Finalmente, conecte as saídas digitais 0 e 1 às entradas de evento 0 e 1 em um micro1401 (ou se você estiver usando um 1401 ou 1401plus padrão, conecte as saídas digitais 0 e 1 às entradas digitais 0 e 1).

O script PPulseAn é um script de análise padrão que indica como a análise dos dados coletados usando o script PPulse pode ser automatizada.

A documentação estendida (em formato Word) é fornecida para ambos os scripts.

Alguns desses scripts vieram de usuários, e não da equipe CED. Se você tiver um script que gostaria de oferecer a outros usuários por meio desta página, diga a Simon Gray. Também fornecemos alguns scripts para Signal.

Esses scripts são armazenados como arquivos WinZip, myscript.zip, exceto onde são mostrados como spike2\scripts\myscript.sgs. Esses últimos arquivos foram instalados com Spike2 e spike2 representa o diretório no qual você instalou Spike2. Veja os resumos clicando na descrição no menu lateral. Então você pode baixá-los clicando no nome do arquivo.

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