Además de los comandos para implementar todas las funciones de procesamiento de datos incorporados descritas anteriormente, el lenguaje de manuscrito de Spike2 tiene acceso total a los datos como arreglos de valores de formas de onda o tiempos de marcador. Dentro del lenguaje de manuscrito hay muchos comandos y funciones matemáticas para utilizar con arreglos, matrices y valores individuales. Los resultados se pueden volver a poner entonces en un archivo de datos, o en cualquier otro tipo de vista, o salida para analizarlos adicionalmente. Los comandos típicos incluyen:
El lenguaje de script también contiene una función para convertir eventos en formato de forma de onda. Aunque existe una función similar a través del uso de canales virtuales, el comando EventToWaveform() permite suavizar la forma de onda resultante con una forma definida por el usuario que puede ser asimétrica.
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