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Programación para Spike2


Experimentos

Reproduce el tono para la detección de la onda-R de ECG
ECGTone.s2s (01/17)

ECGTone.zip

Este manuscrito reproduce un tono ’pip’ desde DAC 0 del 1401 cuando se detecta una onda-R de un ECG complejo durante el muestreo.

El muestreo está controlado vía la barra de herramientas del manuscrito y se pide al usuario que ajuste el canal ECG a monitorizar y un valor de histéresis para la detección pico de la onda-R. Se utiliza entonces un cursor horizontal para configurar un umbral para la detección de la onda-R. Cada vez que se cruza el umbral, el manuscrito monitoriza el nivel de los datos entrantes, y cuando halla el pico, espera a que los datos caigan hasta por lo menos el nivel configurado en el valor de histéresis antes de reproducir el tono para señalizar la detección de la onda-R.

Este manuscrito requiere Spike2 v6.00 o superior.

Ventana de realimentación de la fuerza
BarDisplay.s2s (09/08)

BarDisplay.zip

Este manuscrito es un ejemplo de visualización de un valor de canal on-line en una ventana separada para utilizar en un experimento de realimentación de la fuerza. El manuscrito contiene una rutina inactiva que actualiza la ventana de la barra en respuesta a los datos entrantes de forma de onda en el canal 1.

Este manuscrito requiere Spike2 v4.24 o superior.

Analizar canción de grillo con análisis de ráfaga
SongAn.s2s (01/17)

songan.zip

Análisis de la canción de grillo en impulsos e interferencias, utilizando la función de análisis por ráfaga de Spike2. Se produce una tabla sencilla de resultados. Abra su fichero de datos de la canción de grillo y hágalo visible antes de ejecutar este manuscrito.

Sistema de análisis de posibles medidas cardíacas
Capas.s2s (03/09)

capas.zip

Este extrae ciertos parámetros de los datos de Posibles Medidas Cardíacas (CAP).

Primero se requiere que el usuario seleccione un fichero adecuado para análisis y que especifique el canal CAP. Luego deberá colocar un cursor horizontal en los datos de manera que tache todos los trazos ascendentes del fichero de datos.

Esto permite que el manuscrito ponga marcas en un canal de eventos provisionales cada vez que se localiza el CAP. Entonces el manuscrito intenta extraer ciertas características del CAP; estos valores están escritos en la pantalla.

Las características extraidas incluyen:

Tiempo inicio CAP (Potenciales de acción cardíaca)
Tiempo fin de CAP
Valor de la línea base
Valor pico
Tiempo pico
Gradiente ascendente
Gradiente de repolarización
30, 50, 60, 90 % tiempos de repolarización

El usuario puede hacer clic con el ratón sobre la ventana de texto y con ello se pondrá el cursor en los datos al valor indicado por la posición señalada (es más fácil hacerlo que decirlo).

Todos los resultados deseados se vacía en un fichero de texto.

Arritmia sinusal respiratoria
RSA3.S2S (01/17)

rsa3.zip

Este manuscrito está diseñado para mostrar la arritmia sinusal respiratoria en datos EMG.

Se carga un fichero de datos que contiene un canal de actividad EMG y otro de ondas de presión. Se ajusta un nivel de umbral en el canal de presión para marcar el inicio y el final de cada onda de presión. Por cada intervalo de onda de presión, se comprueba el ritmo del corazón instantáneo a una frecuencia dada y las frecuencias instantáneas se registran en un fichero de texto.

Supervisor del movimiento de la vista
EYEMOVE.S2S (02/03)

eyemove.zip

Este manuscrito permite al usuario trazar los movimientos del ojo en dos dimensiones y muestra las posiciones de fijaciones y movimientos sacádicos de forma gráfica.

Cada experimento consiste en varias pruebas en las que se presenta un estímulo visual a un sujeto y el movimiento del ojo es seguido por un aparato adecuado. Este aparato debería emitir dos voltajes proporcionales a las deflexiones angulares en las direcciones X e Y respectivamente, y estas señales son las entradas al CED 1401 que está conectado al PC que ejecuta el manuscrito. Cuando se inicia una prueba, el manuscrito muestra un trazado XY del movimiento del ojo del sujeto en tiempo real. Los puntos de fijación se marcan conforme avanza el trazo y se obtienen los movimientos sacádicos al final de la prueba. En el fichero de registro se guardan los datos relacionados con estas funciones.

Se incluye un fichero secuenciador muy sencillo, eyemove.pls, el cual envía una señal de salida digital al aparato de estímulo visual para activar una prueba del tipo requerido.

Se facilita un medio para explorar los resultados y datos de vaciado fuera de línea.

El manuscrito requiere un Power1401, un 1401plus o un micro1401; no funciona con un 1401 estándar. Funciona con la versión 3.xx de Spike2 solamente, no con ningún otro programa versión 2.

Trazado X-Y de los movimientos de los ojos
I_track.s2s (02/09)

ltrack.zip

Este manuscrito fuera de línea visualiza los movimientos de los ojos relativos a un objetivo al que se sigue la pista repitiendo el fichero de datos y trazando las coordenadas angulares de cada ojo en una vista X-Y.

Los datos no analizados son una vista de tiempo de los componentes horizontales y verticales del ojo y (opcionalmente) de los movimientos del objetivo, como los registrados por un sistema de cámara de seguimiento de la pupila. Este manuscrito le permite entonces repetir los datos con una visualización simultánea de la pista X-Y seguida por los ojos y el objetivo. Podrá seleccionar la velocidad de la grabación en el rango de 0,1x a 10x de la velocidad real y seleccionar la duración de las pistas que visualizar. Normalmente, elegirá los datos repetidos más recientemente, por ejemplo, los últimos 0,5 segundos.

El manuscrito requiere la versión de Spike2 6.09 o superior.

Se incluye una guía completa del usuario en la sección de comentarios del fichero del manuscrito.

El fichero .zip contiene un fichero de datos de ejemplo que puede utilizar para probar el manuscrito.

Caja Skinner
SKINNER BOX.S2S (01/04)

Skinner.zip

Este manuscrito le permite registrar uno o más canales de datos fisiológicos mientras una rata aprende a pulsar palancas en una caja Skinner. Las veces que pulsa cada palanca se registran como eventos (en los puertos 0 y 1) y el 1401 entrega impulsos de salida TTL para disparar la liberación de una bolita de alimento cuando la rata produce la respuesta requerida. La sincronización de recompensas se registra en el puerto de evento 2. Podrá establecer la duración de un período refractario después de una recompensa durante la cual no se ofrecen más recompensas incluso si la rata pulsa la palanca correcta.

Hay disponibles tres paradigmas experimentales:

  1. Si se pulsa una de dos palancas se recibe una recompensa (formación).
  2. Si se pulsa la palanca izquierda se recibe una recompensa.
  3. Formación inversa. Si se pulsa la palanca izquierda se recompensa un número de veces fijo y posteriormente, solo si se pulsa la palanca derecha se recompensa.
Requisitos de software: Spike2 v3 o superior.
Requisitos de hardware:
Un 1401 estándar es adecuado para registrar un solo canal de datos fisiológicos a una tasa alta de muestreo (10k a 20kHz).
El registro de multicanal a 10kHz o a tasas de muestreo más altas por canal, requiere un dispositivo 1401plus Micro1401 o Power 1401.

Estimulación auditiva y registros de una sola unidad
AudioStimRecSU v705c.s2s (08/20)

AudioStimRecSU.zip

Este paquete de scripts le permite generar estímulos acústicos y/o vibratorios en uno o dos canales, registrar respuestas neurales de una sola unidad y realizar análisis en línea de los picos discriminados en la ventana. Estos manuscritos han sido desarrollados para investigar el sistema auditivo y los órganos de la línea lateral de los peces, pero son también adecuados para una extensa gama de estudios auditivos en vertebrados e insectos.

Este paquete le permite generar estímulos acústicos o vibratorios de intensidad conocida y registrar las respuestas intra o extra celulares a estos estímulos de una sola unidad. Los estímulos disponibles incluyen las crestas de señal armónicas y los estallidos armónicos simétricos o asimétricos con rangos de frecuencia de 1Hz a 10kHz. También se pueden estimular con formas de onda arbitrarias almacenadas (por ejemplo, con sonidos pregrabados) o para disparar un estimulador externo. El script también puede generar secuencias predefinidas de estímulos en un rango de frecuencias e intensidades para la recolección rápida automatizada de las respuestas necesarias para generar las curvas de respuesta de umbral.

El sistema de grabación incluye un discriminador de ventana virtual para la detección de picos. El análisis online de los datos entrantes incluye el tiempo de post-estímulo, el intervalo y los histogramas de fase. Se usan estadísticas circulares para cuantificar el grado de fase-bloqueo de los picos a las formas de onda del estímulo.

Véanse los manuales del usuario para obtener más información.

Requisitos del Sistema:

Hardware: Micro1401 Mk2 o superior. Atenuador programable CED3505
Software: Spike2 v7.11 o superior
Manuscritos: AudioStimRecSU.s2s, SoundCalSU 703.s2s
Configuración de muestreo: SU.s2c
Secuenciador: SU4.pls
Otros archivos: MScaldataSU.txt, SpkcaldataSU.txt, SUSettings.txt
Manuales del Usuario: AudioStimRec SU.pdf, SoundCalSU.pdf, 3505_V2spec.pdf

Respuestas auditivas simples del tallo cerebral
fishabr v1.20.s2s (10/20)

fish abr release.zip

Este paquete de scripts le permite generar estímulos acústicos y/o vibratorios en uno o dos canales, registrar respuestas neurales de una sola unidad y realizar análisis en línea de los picos discriminados en la ventana. Este paquete de manuscrito Spike2 es adecuado para registrar las respuestas auditivas del tallo cerebral (ABR) para armonizar el estímulo de la cresta de señal. Ha sido desarrollado para investigar sobre las respuestas de los peces a los sonidos bajo el agua, pero también puede ser igualmente útil para investigar las respuestas de otros vertebrados al sonido transmitido por el aire.

El manuscrito genera crestas de señal armónicas simétricas con una fase de subida y bajada y están llenas con frecuencias de transportador que van de 5Hz a 10kHz vía DAC0. El usuario puede configurar la forma de la cresta de señal armónica, seleccionar su polaridad (o elegir una polaridad alternativa), la tasa de repetición del estímulo y el número de barridos para incluirlos en la media. La intensidad del estímulo se puede configurar en pasos de 5dB sobre una gama de 75dB utilizando el atenuador controlado por el programa CED. Se aplica automáticamente una curva de calibración para corregir las variaciones en intensidad con la frecuencia del estímulo.

Las respuestas neurológicas preamplificadas y registradas vía ADC0 son procesadas por el promedio de señal. Las respuestas promediadas de cada frecuencia de estímulo se visualizan en orden descendente de intensidad de estímulo para la estimación fácil de los umbrales. El manuscrito construye y visualiza la curva de respuesta de umbral como resultado del experimento. El script también puede generar secuencias predefinidas de estímulos en un rango de frecuencias e intensidades para la recolección rápida automatizada de las respuestas necesarias para generar las curvas de respuesta de umbral.

Requisitos del Sistema:

Hardware: Power1401 o Micro1401 Mk2. Atenuador CED3505
Software: Spike2 v8.00 o superior
Manuscritos: FishABR v1.20.s2s, SoundCalSU v703.s2s
Configuración de muestreo: Fishabr v1.15.s2cx, SU.s2cx
Secuenciador: Fishabr v1.15a.pls, SU7.pls
Otros archivos: MScaldataSU_0.txt, SpkcaldataSU_0.txt, abrsettings.txt
Manuales del usuario: Fishabr v1.16.pdf, SoundCalSU7.pdf

Estudio de la actividad motoneuronal utilizando PSF, PSTH y CUSUM
PSF 03e.s2s (04/18)

psf.zip

Los diagramas de frecuencia de estímulos periféricos (PSF), los histogramas de tiempo de estímulos periféricos (PSTH) y los gráficos de cusum pueden usarse para investigar el curso de tiempo de la entrada sináptica a las motoneuronas. El método supone grabar la actividad de una sola unidad motora a través de electrodos implantados en un músculo mientras se estimula de manera repetida un nervio sensor para generar una entrada sináptica a las motoneuronas.

Dada, una actividad de unidad motora de marca de canal de Event, Marker o WaveMark y una estimulación de marca de canal de Event de la entrada sensorial, este script permite generar trazos PSTH, cusum y PSF en línea y fuera de línea. También puede volver a ejecutar un archivo de datos existente para simular grabaciones en línea con fines de demostración.

El script incluye una guía de usuario detallada y una lista de referencias a los artículos relevantes.

El script necesita Spike2 versión 8.13a o una versión posterior.

Analice las respuestas visuales a las rejillas sinusoidales en movimiento
AR 05.s2s (08/20)

AR05 release.zip

Los estudios de las neuronas sensibles al movimiento en el sistema visual a menudo implican el análisis de las respuestas a las rejillas sinusoidales que se mueven en diferentes ángulos. Con la colaboración de Ribic lab (Dept. de psicología, Universidad de Virginia), hemos desarrollado una combinación de simulación visual con el uso de PsychToolbox y de registro y análisis con Spike2 para analizar las unidades sensibles al movimiento en grabaciones multicelulares. Los resultados toman la forma de los trazos PSTH y los trazos XY de la Respuesta neuronal media frente al Ángulo de estímulo.

El paquete:

  1. especifica los requisitos de hardware
  2. suministra un script Matlab para la generación de estímulos
  3. un script Spike2 para el análisis de datos
  4. un archivo de datos de ejemplo para que pueda familiarizarse con el método.

El script necesita Spike2 versión 9.11 o una versión posterior.

Algunos de estos manuscritos proceden de usuarios más que del equipo CED. Si tiene algún manuscrito que le gustaría ofrecer a sus compañeros usuarios a través de esta página, comuníqueselo a Simon Gray. Nosotros ofrecemos algunos manuscritos para Signal también.

Estos manuscritos se almacenan como ficheros WinZip, myscript.zip, excepto cuando se muestran como spike\scripts\myscript.s2s. Estos archivos se instalaron con Spike2 y spike2 significa el directorio en que ha instalado Spike2. Vea los resúmenes haciendo clic en la línea de descripción, más abajo. Podrá entonces descargarlos haciendo clic en el nombre del archivo; compruebe el tamaño recibido.

Cambridge Electronic Design Limited

Registrado en Inglaterra: 00972132

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  • Cambridge Electronic Design Limited,
  • Technical Centre,
  • 139 Cambridge Road,
  • Milton,
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Para nuestros clientes estadounidenses, podemos proporcionar el formulario de impuestos W-8BEN, que nos identifica como una empresa del Reino Unido.

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