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Programación para Spike2


En-línea

Función ZAP: Salida de la onda senoidal con aumento de frecuencia
ZAPexample.s2s (01/17)

ZAPexample.zip

Se puede utilizar este manuscrito y la secuencia asociada para generar una onda senoidal con un aumento de frecuencia lineal o cuadrática a partir de DAC 0 o de la interfaz del 1401. Para ver la salida, conecte DAC 0 a ADC 0, cargue la configuración de muestreo incluida, ZAPexample.s2c y seleccione el fichero de secuencia de texto, ZAPexample.pls, desde la pestaña Sequencer.

El manuscrito abre un nuevo fichero de datos listo para muestrear basado en la configuración de muestreo actual. Los ajustes de la onda senoidal están controlados desde un botón de la barra de herramientas del manuscrito y se puede actualizar durante el muestreo.

Este manuscrito requiere Spike2 v7.00 o superior y una interfaz de Micro1401 o de Power1401.

Rampa lineal de frecuencia de impulso
LinRampFreq.s2s (01/17)

LinRampFreq.zip

Este manuscrito y la secuencia asociada crea rampas de frecuencia de impulso crecientes y decrecientes on-line y permite al usuario introducir ajustes para el tiempo de la rampa además del inicio, punto de cambio y frecuencias finales para la salida del impulso.

Antes de ejecutar el manuscrito, debe asegurar que se selecciona la secuencia de salida LinRampFreq.pls en la pestaña Sequencer de su configuración de muestreo. El manuscrito configura un nuevo fichero de datos de registro basado en la configuración actual de muestreo.

Con fines de prueba, ajuste el canal 1 en su configuración de muestreo para que sea un canal de Evento en el que se puedan grabar los impulsos para ayudarle a visualizar los resultados. Los impulsos están configurados para que sean 10us de longitud y están fuera de una salida digital 0 del 1401

Este manuscrito requiere Spike2 v5.17 o superior y una interfaz de Micro1401 o de Power1401.

Salida pre-registrada de los tiempos pico como estímulo
PlaySpikeTimes.s2s (05/10)

PlaySpikeTimes.zip

Este manuscrito y su secuencia asociada es un ejemplo del uso de la tabla del secuenciador para dar salida a una serie de eventos pre-registrados durante el muestreo. Seleccione el fichero de secuencia PlaySpikeTimes.pls en la pestaña Sequencer de su configuración de muestreo antes de ejecutar el manuscrito.

Al ejecutarlo, el manuscrito apremia al usuario a abrir un fichero de datos que contiene los picos o eventos que utilizar y seleccionar una gama de tiempo de eventos para escribir en la tabla del secuenciador. Durante el muestreo, teclear ’a’ ejecutará los datos copiados fuera de la salida digital 0.

Este manuscrito requiere Spike2 v5.17 o superior y una interfaz de Micro1401 o de Power1401.

Ajusta automáticamente la tasa de video en relación con la actividad pico
VideoRate.s2s (08/10)

VideoRate.zip

Este manuscrito se puede utilizar para monitorizar un evento o canal WaveMark y conmutar entre la tasa de imagen lenta y la tasa de imagen normal según sea el nivel de actividad en el canal nominado. Podrá especificar el intervalo mínimo entre los eventos que señalan el inicio de un período de baja actividad.

Este manuscrito requiere Spike2 v5.17 o superior.

Aplica los filtros IIR a un canal de forma de onda on-line
OnlineFilter.s2s (06/16)

OnlineFilter.zip

Este manuscrito es un ejemplo de la aplicación de los filtros IIR a un canal de forma de onda nominado durante el muestreo. Abre un nuevo fichero de datos basado en la configuración de muestreo actual y genera entonces un diálogo desde el cual el usuario puede especificar el tipo de filtro que aplicar y el canal de forma de onda fuente que utilizar

Una vez iniciado el muestreo, el manuscrito utiliza la rutina inactiva para aplicar el filtro a los datos fuente y producir un nuevo canal de memoria para visualizar el resultado.

Este manuscrito requiere Spike2 v6.01 o superior.

Aplicación de un filtro IIR para varios canalesde forma de onda en línea
OnlineFilter 04.s2s (06/16)

OnlineFilterMulti.zip

Este script le permite aplicar un filtro digital IIR a uno o varios canales de forma de onda en línea. El filtro, tal y como se entrega, puede aplicar el filtro elegido hasta un máximo de cuatro canales de forma de onda muestreados a la misma frecuencia. Un cambio menor al script le permite incrementar el número de canales que pueden procesarse.

Es posible elegir una amplia gama de tipos de filtros que incluye: entalla, resonancia, paso bajo, paso alto, paso de banda y paro de banda. Las características del filtro pueden elegirse de: Tipo 1 Butterworth, Bessel, Chebyshev y tipo 2 Chebyshev.

Hay una guía del usuario en los comentarios al inicio del archivo del script.

Este script necesita Spike2 v8.03 o una versión posterior.

Generador de impulsos de 3 canales para estimulación intracelular
PulseGen 01.s2s (09/19)

PulseGen.zip

Esta combinación de script/secuenciador está prevista para usar con un amplificador de microelectrodos multicanal con pinza de corriente. Le permite estimular hasta tres neuronas registradas simultáneamente para probar la conectividad sináptica. Las duraciones e intensidades de los estímulos se controlan a través de un diálogo que permite realizar rápidamente los ajustes. También permite cambiar rápidamente entre una pantalla desplazada y sobretrazada, barridos desencadenados.

También incluye una configuración de muestreo de ejemplo para probar fácilmente el sistema.

Hay una guía de usuario al inicio del archivo de script que puede imprimirse para consulta.

Requisitos de software: Spike2 versión 8.17 o posterior

Requisitos de hardware: Power 1401

Impulso desde el cruce de umbral
THRESPUL.S2S (07/15)

threspul.zip

Este manuscrito on-line está escrito para ser usado con Spike2 de Windows versión 3 y posterior.

Detecta el tiempo de cruce de umbral en un canal de forma de onda y marca estos tiempos en el archivo o deja salir un impulso TTL en el momento de la detección. El umbral se configura con un cursor horizontal que puede moverse en cualquier momento durante la grabación.

Antes de ejecutar el manuscrito, necesita asegurar que se ha establecido una configuración de muestreo adecuada. Esta configuración debe contener por lo menos un canal de forma de onda. Si selecciona una salida a un impulso TTL en el momento de la detección del umbral, deberá elegir configurar un canal de evento o de nivel con fines de prueba.

Para ejecutar el manuscrito, vaya al menú de manuscrito y seleccione Ejecutar manuscrito. Si el manuscrito está ya cargado, aparecerá en el menú; de lo contrario, seleccione Cargar y ejecutar lo cual generará un diálogo de selección de archivo desde el que podrá hallar y cargar el manuscrito threspul.s2s.

Cuando se ejecuta el manuscrito, aparece un diálogo, desde el cual podrá configurar los ajustes requeridos:

Canal de entrada -
Canal de forma de onda en el que fundamentar la sincronización del cruce de umbral
Umbral -
Dirección de cruce de umbral. Positivo (subiendo) o negativo (bajando)
Acción -
Impulso de TTL y/o marcador del canal de la memoria


Cuando se pulsa OK en este diálogo, el manuscrito abre un nuevo archivo de datos, listo para hacer un muestreo con un cursor horizontal colocado en el canal de forma de onda seleccionado. Éste deberá colocarse a un nivel inicial razonable para el umbral, y pulsar el botón OK para continuar.

Cuando esté listo para hacer un muestreo, aparecerá una barra de herramientas desde la cual podrá controlar el muestreo de los datos.

Salir -
Se sale del manuscrito y se cierra la barra de herramientas
Iniciar muestreo -
Comienza el muestreo de los datos
Parar muestreo -
Interrumpe el muestreo. Este botón está desactivado hasta que se empieza a hacer el muestreo
Nuevo archivo -
Cierra el archivo actual y abre un nuevo archivo listo para hacer un muestreo


Salida de TTL
La salida predeterminada de TTL entrega un impulso de 1ms de duración desde la salida digital 0 (bit 8) de la interfaz 1401. La velocidad total de la secuencia y la duración del impulso y la selección del bit de salida pueden ser editadas en el archivo pulse.pls, si lo requiere.

El manuscrito escribe un archivo de secuencia de salida Spike2 que se almacena con un nombre predeterminado (pulse.pls) en el subdirectorio de secuencia del directorio principal de Spike2 en que se almacena la aplicación (p.ej. C:\Spike4\Sequence\pulse.pls).

Marcador del canal de memoria
Si selecciona el Marcador del canal de memoria, se crea un canal temporal que se visualiza en el archivo de datos. Cada vez que se cruza el umbral, se importan marcadores a este canal en una posición lo más cercana posible al cruce actual de umbral.

Este canal es temporal y si desea guardar los datos con el archivo de datos grabado deberá escribirlos en un canal permanente. Para hacerlo, vaya al menú Análisis y seleccione Memoria intermedia y seguidamente Escribir en el canal. Desde el diálogo podrá entonces seleccionar un canal vacío en el cual escribir estos datos.

Tiene cuidado de que los niveles de grabación permanezcan siempre dentro de los límites recomendados
LVLmeter.s2s (07/05)

lvlmeter.zip

En algunos tipos de experimentos puede que se necesite ajustar la ganancia y desviación de los preamplificadores externos repetidamente durante el curso de una grabación. Es importante seguir la pista a estos cambios y asegurar que los niveles de grabación permanecen siempre dentro de los límites recomendados. El manuscrito medidor de niveles le puede ayudar a satisfacer estos requisitos. Genera una vista duplicada de sus datos entrantes con cada canal visualizado relativo a la gama total de entrada del 1401. Le da avisos audibles y visuales si cualquiera de las trazas se acerca a los límites de la gama de trabajo. El manuscrito le permite además mantener un registro de la ganancia, de la desviación y de otros cambios anotando el archivo de datos con TextMarks.

Este manuscrito requiere Spike2 versión 5 o superior.

Genera estallidos sonoros de chasquido y acústicos para la reproducción online
WaveMake 02.s2s (11/07)

wavemake.zip

Este manuscrito le permite crear estallidos sonoros, ruidos acústicos o chasquidos y guardarlos en una configuración de muestreo. Estas formas de onda están entonces disponibles para reproducirlas vía una salida DAC del 1401 como estímulo audible durante las sesiones de grabación siguientes.

Los estímulos de chasquido pueden tener una dirección positiva o negativa. Las frases de subida y bajada de los estallidos sonoros pueden tener una duración fija o un número exacto de ciclos de la forma de onda subyacente (pitidos de tono). El manuscrito también puede crear secuencias de estallidos sonoros idénticos separados por intervalos fijos. De este modo, puede crear por ejemplo un chirrido sintetizado con 4 sílabas espaciadas por igual.

Se pueden almacenar hasta 10 estímulos audibles en una configuración de muestra. Puede reproducirlos en modo de ‘toma individual’ pulsando un botón en la barra de herramientas PlayWave durante una sesión de grabación. Utilice el manuscrito WavePlay para reproducir las formas de ondas seleccionadas repetitivamente. Se incluyen en la sección de comentarios del archivo de manuscrito las instrucciones completas para el usuario.

Requisitos de Software : Spike2 versión 5.14 o superior.

Hardware: no compatible con el 1401 Estándar.

Manuscrito de estimulación auditiva simple y grabación
Waveplay v1.03.s2s (06/06)

waveplay.zip

Este manuscrito le permite reproducir formas de onda arbitrarias (ondas de reproducción) repetitivamente, vía una o más salidas DAC durante la grabación. Una aplicación típica puede ser reproducir estallidos de tonos repetidos, o chasquidos creados con el manuscrito WaveMake mientras se graban las respuestas audibles. Sin embargo, hay muchas otras posibilidades.

Este manuscrito le permite seleccionar un conjunto de formas de onda para reproducirlas durante la siguiente sesión de grabación y establecer parámetros de sincronización, como la tasa de repetición y el número de repeticiones. Los estímulos y las respuestas se pueden entonces visualizar como barridos disparados o en modo de ’grabador de gráficos’. El manuscrito también tiene la opción de reproducir dos estímulos diferentes alternativamente. Una aplicación típica sería la presentación alternativa de los chasquidos de condensación y de enrarecimiento. Se incluye una guía de usuario completa en la sección de comentarios del manuscrito.

Requisitos de Software: Spike2 versión 5.14 o superior. El manuscrito funciona en conjunción con un secuenciador de texto: PlayWaveform02.pls. Este archivo se deberá almacenar en la ’secuencia’ de nombres de la carpeta dentro del directorio principal de Spike2.

Requisitos de Hardware: No compatible con la interfaz de 1401estándar

Algunos de estos manuscritos proceden de usuarios más que del equipo CED. Si tiene algún manuscrito que le gustaría ofrecer a sus compañeros usuarios a través de esta página, comuníqueselo a Simon Gray. Nosotros ofrecemos algunos manuscritos para Signal también.

Estos manuscritos se almacenan como ficheros WinZip, myscript.zip, excepto cuando se muestran como spike\scripts\myscript.s2s. Estos archivos se instalaron con Spike2 y spike2 significa el directorio en que ha instalado Spike2. Vea los resúmenes haciendo clic en la línea de descripción, más abajo. Podrá entonces descargarlos haciendo clic en el nombre del archivo; compruebe el tamaño recibido.

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