Dans un certain nombre de situations, il peut être nécessaire d'utiliser plusieurs 1401 au sein d'un même montage expérimental. Ainsi par exemple, lors de l'utilisation du logiciel Spike2, il pourra être nécessaire de disposer d'un plus grand nombre de canaux d'entrée de forme d'onde que ce qui est disponible sur un seul 1401 dont l'extension est déjà complète. Pour surmonter ce problème, l'option de synchronisation permet à l'utilisateur de relier plusieurs systèmes 1401 entre eux.
La liaison de systèmes séparés soulève le problème du minutage. Utilisé de manière indépendante, chaque 1401 peut démarrer avec la même impulsion de déclenchement, mais ensuite tourner à une vitesse d'horloge déduite de sa propre horloge à cristaux.
La précision de l'horloge interne est de 50 parties par million ou davantage avec le temps et selon la température d'exploitation. Cela signifie que deux 1401 lancés par la même impulsion de départ pourrait accuser une différence maximale d'une seconde au bout de 6 heures. Pour de nombreuses applications, cela n'aura pas beaucoup d'importance, mais pour des procédures expérimentales, utilisant plusieurs 1401, il sera parfois difficile d'aligner des événements enregistrés au préalable par différents 1401.
Pour résoudre ce problème, le Power1401, le Micro1401-4, 3 et 2 CED dispose d'une option installée en usine pour synchroniser plusieurs 1401 afin que leurs horloges à cristaux restent parfaitement synchrones.
Une fois en place, l'option de synchronisation pour le Micro1401 ajoute un connecteur à panneau arrière dans lequel s'enfiche un câble marguerite. La configuration du câblage détermine quel Micro1401 dispose de l'horloge "maître" et les unités "esclaves". Un 1401 esclave détecte un signal d'horloge d'entrée et mesure sa fréquence. S'il apparaît que le signal externe est une horloge acceptable, il commutera son horloge de référence pour utiliser la fréquence externe au lieu d'un cristal interne. Ce procédé est automatique et ne requiert aucune intervention de la part du logiciel. Le signal d'horloge est généré dans chaque 1401 pour passer la prochaine unité. Les longueurs de câble peuvent atteindre 2 mètres entre différents 1401.
Le nombre de 1401 pouvant être synchronisés de cette manière est de 3 ou 4, déterminé par le câblage. Pour synchroniser un plus grand nombre de 1401, CED à l'intention de lancer un boîtier de synchronisation externe faisant office de "maître" et de produire des horloges pour 8 "esclaves" au maximum. Cette unité disposera également d'équipements pour se connecter à des sources externes de fréquence comme des machines DAT et des verrous de générateur vidéo fournis par l'utilisateur.
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