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Avancé fonctionnalités

Contrôle expérimental et séquencement de stimuli

Le séquenceur de sortie Spike2 peut effectuer un contrôle expérimental complexe et des protocoles de séquencement de stimuli pendant la capture de données, ceci en utilisant jusqu'à 16 sorties TTL et 8 sorties de forme d'onde. La synchronisation est très précise, étant contrôlée au niveau de l'interface CED 1401, et non pas de l'ordinateur hôte. Le séquenceur de sortie peut être changé pendant l’échantillonnage.

Les protocoles de sortie peuvent être définis de deux manières. Un éditeur graphique fournit toutes les fonctionnalités requises par la majorité des utilisateurs, leur permettant de créer des ensembles multiples de sorties d'impulsion, notamment impulsions carrées, ondes sinusoïdales et rampes, ainsi que des formes d'onde préenregistrées ou définies par l'utilisateur. Voir une video de demonstration. Pour les applications plus exigeantes, un éditeur de texte est disponible et vous permet d'éditer directement les étapes du séquenceur. Ceci permet de contrôler la séquence de façon interactive par l'intermédiaire du langage de script et grâce à l'utilisation de variables et tableaux.

L'accès en temps réel du séquenceur aux données d'événements et de forme d'onde reçues assure des réponses très rapides aux changements de niveau de forme d'onde et aux détections d'événements.

Éditeur de séquence graphique Spike2 affichant les différentes
sorties et les options de contrôle supplémentaires

Détection et classement de pointes

Spike2 identifie et classe l'activité de pointe d'une ou plusieurs unités, ceci en ligne comme hors ligne. Il peut marquer des événements à l'aide de franchissements de seuil simples ou classer jusqu'à 32 canaux en ligne, avec reconnaissance de gabarits de forme de pointe d'ondes complètes par système d'appariement concordance matricielle pour les données à trace unique et n-trode data. Voir une video de demonstration.

Pour les enregistrements à unités multiples, Spike2 intègre des outils permettent de classer les pointes selon leurs formes. Tous les événements franchissant un seuil donné sont capturés. Voir une video de demonstration. Les pointes sont ensuite classées en différents groupes, en associant les techniques de concordance matricielle et la découpe en grappes, basée sur l'analyse en composantes principales ou sur des mesures, corrélations ou erreurs définies par l'utilisateur. Les pointes peuvent également être triées de façon interactive en traçant simplement une ligne à travers elles et en plaçant dans une certaine catégorie les pointes étant traversées par celle-ci. L'analyse de collision de pointes permet par ailleurs de séparer des collisions d'unités en comparant la forme de la pointe en cours avec des paires de modèles (ou gabarits) existants.

Les méthodes de découpe de grappes permettent de représenter les valeurs mesurées en une vue 3D ; il est ainsi possible de les visionner en rotation tridimensionnelle et de les relire de manière à suivre l'évolution des pointes dans le temps. Les grappes sont formées par des algorithmes automatiques ou par placement manuel d'ellipses. Les fonctionnalités interactives incluent les INTH pour les classes de grappe en cours, le suivi dans le temps, et la sélection de pointes individuelles par clic de souris sur leur point au sein de la grappe.

Discrimination de pointes à unités multiples au moyen d'une
mise en grappe par analyse en composantes principales

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L'éditeur de séquence graphique de Spike2 offre une interface conviviale pour le séquenceur de sortie intégré. Ce tutoriel vidéo propose une introduction à l'éditeur graphique et explique comment il peut être utilisé pour configurer diverses sorties qui seront employées au cours de l'échantillonnage.

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Un certain nombre de paramètres sont utilisés pour définir la façon dont les gabarits de pointe sont formés et la façon dont les pointes entrantes sont appariées à des gabarits. Ce tutoriel vidéo explique comment ces paramètres peuvent être modifiés à l'aide du dialogue Template Parameters.

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Lorsque vous définissez un nouveau canal WaveMark, les deux curseurs horizontaux par défaut dans la fenêtre 'oscilloscope' de la forme d'onde sont utilisés pour définir les niveaux de déclenchement positifs et négatifs pour la détection de pointe. Ce tutoriel vidéo vous montrera les choses à faire et à éviter lorsque vous définissez des déclencheurs de seuil pour le tri de pointes.

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