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Spike2 程式


實驗

播放ECG R波形檢測鈴聲
ECGTone.s2s (17年1月)

ECGTone.zip

如果取樣期間檢測到ECG組合的R波,這個腳本會從1401的DAC 0發出’嗶嗶’的鈴聲。

取樣通過腳本工具欄控制,腳本會讓用戶設置要監視的ECG通道和R波峰值檢測的滯後值,然後用水準游標設置R波檢測的閥值。每次超過閥值,腳本都會監測進入資料的水準,並在發現峰值後等待資料下降, 幅度至少達到滯後值設定的水準,然後才播放鈴聲,表示檢測到R波形。

這個腳本要求Spike2 v6.00或更高版本。

力回饋顯示
BarDisplay.s2s (08年9月)

BarDisplay.zip

這個腳本是在單獨的視窗中顯示線上通道值、用於力回饋實驗的例子。腳本包含一個空閒例行程式,會根據通道1進入的波形資料更新工具欄顯示。

這個腳本要求Spike2 v4.24或更高版本。

用脈衝分析法分析蟋蟀鳴聲
SongAn.s2s (17年1月)

songan.zip

用Spike2的脈衝分析功能將蟋蟀鳴聲分析爲脈衝信號。提供簡單的結果資料表。運行前請先打開並顯示您的蟋蟀鳴聲資料檔案。

心動電位分析
Capas.s2s (09年3月)

capas.zip

該程式從心動電位 (CAP) 資料中析取特定參數。

首先要求用戶選擇一個合適的文件進行分析並確定CAP通道。然後需要在資料檔案上放置一個水平游標,讓它穿過資料檔案的所有上行線。

這樣程式每次找到CAP時就能在臨時事件通道上進行標記。隨後程式從CAP中析取特定的參數;這些數值將在螢幕上顯示。

析取的特徵包括:

  • CAP 起始時間
  • CAP 結束時間
  • 基準值
  • 峰值
  • 峰值時間
  • 上行梯度
  • 再極化梯度
  • 30, 50, 60, 90 % 再極化時間

用戶可以在文本視窗中點擊滑鼠,在資料上放置游標,點擊位置指示其數值(說起來麻煩,做起來很簡單)。

所需的結果都被轉儲爲文字檔案。

呼吸性竇性心率失常
RSA3.S2S (17年1月)

rsa3.zip

該程式設計用於顯示EMG資料中的呼吸性竇性心率失常信號。

程式載入資料檔案,其中有一個通道的EMG活動資料和一個通道的壓力波形資料。對壓力通道設定一個閾值水平,對每個壓力波形的起點和 終點進行標記。對每個壓力波形間隔,按預先設定的頻率對暫態心率採樣,並將暫態頻率資料寫入文字檔案。

眼球運動監視器
EYEMOVE.S2S (03年2月)

eyemove.zip

該程式允許用戶繪製二維眼球運動圖,並用圖形顯示眼球固定位置及快速掃視運動 。

每項試驗由一系列測試組成,受驗者接受視覺刺激,用合適的儀器跟蹤其眼球運動。該儀器應該輸出兩個電壓,分別與X和Y方向上的角度偏移量成正比, 這些再作爲輸入信號送至CED 1401,運行該程式的PC機上連接1401設備。測試開始時, 程式即時顯示受驗者眼球運動的XY座標圖。隨著跟蹤進展,可以對眼球固定位置作出標記,並在測試結束時繪製快速掃描運動圖。 與這些特徵有關的資料記錄在日誌文件中。

帶一個簡單的音序器文件eyemove.pls,它向視覺激勵儀器發出數位輸出信號,觸發所需的測試類型。

提供結果掃描和資料離線轉儲功能。

該程式要求使用 Power1401、1401plus 或micro1401;不能在標準1401 上運行。它僅適用於Spike2 的 3.xx 版本,不能與第2版程式配合使用。

眼睛運動的X-Y平面繪圖
I_track.s2s (09年2月)

ltrack.zip

這個離線腳本通過重播資料檔案顯示眼睛隨著一個被跟蹤目標的運動並在X-Y視圖繪製每只眼的角座標。

原始資料是眼睛和(可選的)目標運動的水準和數值分量的時間視圖,就如所記錄的學生追蹤攝像機系統一樣。這個腳本允許你重播資料同時同步顯示跟隨眼睛和物體的X-Y軸數據。 你可以在實際速率的0.1x到10x的範圍選擇重播的速率,並且選擇顯示資料的時間長度。典型地,你可以選擇顯示最近重播的資料,例如最近0.5秒的數據。

該腳本需要Spike2版本6.09或更高版本支援。

完整的用戶手冊包含在腳本檔的評論部分。

.zip檔中包含實例數位檔,可用來試驗腳本。

Skinner box
SKINNER BOX.S2S (04年1月)

Skinner.zip

這個程式允許你在Skinner box(斯金納箱)中的老鼠學會按杠杆的同時記錄下一個以上心理資料的通道。每次按杠杆的時間被記錄為事件(在埠0和1上), 1401會產生TTL輸出脈衝,在老鼠做出符合要求的反應時釋放一個食物球。獎勵的時間記錄在事件埠2上。你可以在一次獎勵之後設置一個不應期, 即使老鼠按中正確的杠杆也不給與獎勵。

提供三個試驗性範例:

  1. 按兩個杠杆中的任何一個均可獲得獎品(訓練)。
  2. 按左邊的杠杆可獲得獎品。
  3. 反向學習。按左邊的杠杆可獲得若干次的獎勵,然後只有按右邊的杠杆才能獲得獎勵。
軟體要求:Spike2第3版或更高。
硬體要求:
標準的1401適合用來按高取樣率(10k到20kHz)記錄單一通道的心理資料。
10kHz或更高取樣率的多通道記錄要求每個通道配置一個1401plus,Micro1401或Power 1401。

建立複雜波形
Chirpetc.S2S (24年2月) 改進!

chirp.zip

該聽覺刺激和錄音指令碼讓您可以:

  • 建立複雜的波形,例如啁啾、斜坡、啁啾/斜坡組合、突發噪音、突發音調和刺激序列。
  • 將多個波形加入採樣設定,然後在採樣期間,透過 1401 DAC 輸出,作為聽覺刺激播放。
  • 在採樣設定中載入最多 20 個不同的刺激(受 1401 記憶體限制),以在多個刺激間輕鬆切換。
  • 按下 Play wave(播放波形)列上的按鈕觸發單次播放刺激,或以指令碼控制依序播放刺激。
  • 以固定間隔重複播放刺激、在兩個固定間隔間嚴格或隨機交替播放,或在定義範圍內以隨機間隔播放刺激。
  • 控制 CED3505 可程式設計衰減器。
  • 記錄對這些聽覺刺激的生理反應,並以觸發掃描或捲動模式顯示。
  • 使用範例採樣設定 Chirp eg.s2cx 進行測試。
  • ToneCal 指令碼(內含)讓校正刺激強度更容易。

硬體要求:

  • Power 1401、Micro1401 mkII、Micro3 或 ±5V 範圍內的 Micro4。
  • CED3505 可程式設計衰減器(如果需要刺激強度的指令碼控制)。
  • 合適的音訊放大器和揚聲器或耳機。

這個腳本要求Spike2 v8.25或更高版本。

聽覺刺激與單一神經元記錄
AudioStimRecSU v705c.s2s (20年8月)

AudioStimRecSU.zip

這個腳本的封裝允許你在一個或兩個通道上生成聲學的和/或振動的激勵,記錄神經系統的單個單元的回應,並對窗函數鑒別的尖峰執行線上分析。 這些程序以前是為了研究魚類的聽覺系統和側線器官而開發的,不過應該也適合對脊椎動物和昆蟲的各種聽覺研究。

使用這個程序包,你可以生成已知強度的聲學或振動刺激,記錄對這些刺激的細胞內或細胞外單一神經元反應。可用的刺激包括短音和均勻或不均勻猝發音,頻率在1Hz到10kHz之間。 此外還可以用保存的任意波形(例如預先錄製的聲音)進行刺激,或觸發一個外部刺激器。該腳本還可以生成在一定頻率和強度範圍內的預定序列的激勵,用於快速自動收集生成閾值響應曲線所需的回應。

記錄系統包括一個用於尖峰檢測的虛擬窗口辨別器。 輸入數據的在線分析包括刺激後時間、間隙和狀態柱狀圖。 程序採用循環統計法來量化尖峰對刺激波形的鎖相程度。 詳細情況請參見用戶指南。

系統要求:

硬件: Micro1401 MK2版或更高版本、CED3505可編程衰減器
軟件: Spike2 v7.11或以上
腳本: AudioStimRecSU.s2s、SoundCalSU 703.s2s
取樣配置: SU.s2c
序列器: SU4.pls
其他文件: MScaldataSU.txt、SpkcaldataSU.txt、SUSettings.txt
用戶指南: AudioStimRec SU.pdf、SoundCalSU.pdf、3505_V2spec.pdf

簡單的聽性腦幹反應
fishabr v1.20.s2s (20年10月)

fish abr release.zip

這套Spike2程序包適合用於記錄對短音刺激的聽性腦幹反應(ABR)。這個程序包以前是為了研究魚類對水下聲音的反應而開發的,不過對於研究其他脊椎動物對空氣傳播的聲音的反應可能同樣有用。

這個程序會通過DACO生成含線性升降狀態和充滿5Hz到10kHz載頻的均勻短音。用戶可以設置短音的形式、選擇極性(或挑選交變極性)、刺激重複率以及平均值包含的掃描數目。 刺激強度可以用CED程序控制的衰減器設置為75dB範圍內,每5dB為一級。自動應用校準曲線糾正刺激頻率強度的變化。

通過ADCO記錄的放大前的神經反應通過信號求平均值進行處理。各個刺激頻率的平均反應按刺激強度的降序顯示,以方便估計臨界值。程序在實驗進行的同時形成並顯示臨界值反應曲線。

系統要求:

硬件: Power1401或Micro1401 Mk2、CED3505可編程衰減器
軟件: Spike2 v8.00或以上
腳本: FishABR v1.20.s2s, SoundCalSU v703.s2s
取樣配置: Fishabr v1.15.s2cx, SU.s2cx
序列器: Fishabr v1.15a.pls, SU7.pls
其他文件: MScaldataSU_0.txt, SpkcaldataSU_0.txt, abrsettings.txt
用戶指南: Fishabr v1.16.pdf, SoundCalSU7.pdf

使用 PSF、PSTH 和 CUSUM 研究運動神經元活動
PSF 03e.s2s (18年4月)

psf.zip

外周刺激頻率圖 (PSF)、外周刺激時間直方圖 (PSTH) 及累計圖可用於研究運動神經元突觸輸入的時間過程。該方法包括在重複刺激感覺神經以產生運動神經元突觸輸入的同時,透過植入肌肉中的電極記錄單個運動單位的活動。

提供一個標記運動單位的 Event、Marker 或 WaveMark 通道和一個標記感官輸入刺激的 Event 通道,該指令碼允許您線上或離線產生 PSTH 圖、累計圖和 PSF 圖。您還可以為了進行示範,重新執行現有的資料檔案以模擬線上記錄。

該指令碼包含詳細的使用指南和相關文章的參考清單。

該指令碼需要使用 Spike2 版本 8.13a 或更高版本。

分析對移動正弦光柵的視覺回應。
AR 05.s2s (20年8月)

AR05 release.zip

視覺系統中對運動敏感神經元的研究,通常涉及對以不同角度移動的正弦光柵的回應的分析。與 Ribic 實驗室(維吉尼亞大學心理學系)合作,我們開發了使用 PsychToolbox 進行視覺刺激以及使用 Spike2 進行記錄和分析的組合,以分析多細胞記錄中的運動敏感單元。結果採用平均神經元反應與刺激角度的 PSTH 圖和 XY 圖的形式。

該程式包:

  1. 指定了所需的硬體
  2. 提供了 Matlab 指令碼來產生刺激
  3. 提供了一種用於資料分析的 Spike2 指令碼
  4. 提供了一個範例資料檔案,方便您熟悉該方法。

該指令碼需要使用 Spike2 v9.11 或更高版本。

上面部分程式不是CED的成果,而是用戶自己編寫的。 如果您也寫有程式,希望通過這個網頁與大家分享,請告訴Simon Gray。 我們還提供了一些Signal專用程式。

這些腳本儲存為WinZip檔、myscript.zip, ,顯示為spike\scripts\myscript.s2s. 的地方除外。代表你安裝Spike2的目錄。 點擊下面的描述行可以查看概要。然後你可以通過點擊檔案名開始下載;請檢查收到的檔大小。

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