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Spike2 程式


控制

控制Telemetry Research介面
TR Control.s2s (10年5月)

TR Control.zip

這個腳本和相關聯的序列是與Telemetry Research介面互動的例子。腳本可以創建一個工具欄,允許用戶控制取樣,設置記錄週期和間隙的長度。

1401的0號數位輸出端應連接到Telemetry Research發射機的觸發輸入端,DAC 0連接到外部通道選擇輸入端,選擇1到12之間的通道。然後將你想要取樣的信號連接到DAC 0。

這個腳本要求Spike2 v5.17或更高版本。

控制Digitmer DS5刺激器
DS5Control.s2s (17年1月)

DS5Control.zip

這個腳本和相關聯的序列是使用1401的DAC輸出控制Digitimer DS5獨立式雙極性恒流刺激器的例子,可以在取樣期間更新設置。

這個腳本要求Spike2 v6.14或更高版本。

Associative learning in mice
Lick 02.S2S (24年9月) 新!

Lick 02.zip

This online script is intended for training a laboratory animal to respond to a stimulus by providing a reward when the desired behaviour is elicited within a specified time window. The script triggers the test stimulus at random intervals, records the behaviour and triggers reward delivery when the required criteria are met. The script also generates counts and plots vs. time of: "hits", "misses", "false positives" and "rejections" (where a rejection is a lack of response in random time windows between stimuli.

Specifically, the script is designed for studies of the type described by Paricio-Montecinos et al (2020). Here the stimulus is innocuous warming or cooling of the glabrous skin of a thirsty mouse's forepaw. The behaviour monitored is licking the spout of a water bottle and the reward is water, only delivered in response to licks during the thermal stimulus. Such studies aim to investigate perceptual thresholds and peripheral and central neural mechanisms of thermo-sensitivity.

The script might, with small modifications, also be useful for other learning or Go/No Go studies that involve different stimuli, behaviour and rewards, e.g. visual cues eliciting lever presses for a food reward.

Reference: Paricio-Montecinos et al. Sensory Coding of Warm Perception, Neuron 106, 830–841 (2020)

Requirements:
Hardware - Micro 1401 MkII or higher (plus appropriate hardware to generate the stimulus and provide the reward when triggered).

Software - Spike2 v9.19 or higher

波形捕捉校準
CALIB.S2S (17年1月)

calib.zip

該程式允許用戶對波形通道採樣設置中的量程和偏移量進行校準。首先創建一個採樣設置文件(或用原有文件),然後運行程式。 您可以將採樣資料寫入臨時的資料檔案。 資料採樣過程中,您應該讓待校準的波形在確定的兩個不同水平上分別保持一段較短時間。

然後按 "Calibrate"(校準)按鈕。這樣您就可以選擇通道波形的兩個水平段,指定它們的數值應該是多少。 然後程式將更改通道採樣設置的量程和偏移量,以符合您指定的數值。

産生成對脈衝;分析結果
PPULSE.S2S (17年1月)

ppulse.zip

成對脈衝程式 - PPulse將成對脈衝發送給數位輸出埠0 和1。脈衝時間間隔(激勵間隔時間) 是從一系列可能值(保存在約定文字檔案中)中隨機選擇的。

要運行這個程式,先確認您有排序文件PPulse1、PPulse2以及PPulse3, 與PPulse程式在一個目錄下。同一目錄下還須有一個文字檔案,其中有要用到的ISI(我們提供一個示例文字檔案, 叫做ISITimes)。

最後,將數位輸出埠0和1連接到micro1401的事件輸入埠0和 1(如果您用的是標準1401或1401plus,將數位輸出埠0和 1連接到數位輸入埠0和1即可)。

PPulseAn 是一個標準的分析程式,它表明怎樣自動分析用PPulse程式採集的資料。

兩個程式都帶有擴展文檔(Word格式)。

上面部分程式不是CED的成果,而是用戶自己編寫的。 如果您也寫有程式,希望通過這個網頁與大家分享,請告訴Simon Gray。 我們還提供了一些Signal專用程式。

這些腳本儲存為WinZip檔、myscript.zip, ,顯示為spike\scripts\myscript.s2s. 的地方除外。代表你安裝Spike2的目錄。 點擊下面的描述行可以查看概要。然後你可以通過點擊檔案名開始下載;請檢查收到的檔大小。

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