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Scripts Signal


Analyse

Mesures de pic à pic.
PktoPk.sgs (02/15)

PktoPk.zip

Ce script mesure les amplitudes de pic à pic à partir de canaux multiples et sépare les valeurs en différents états au sein d'une vue XY.

Ce script nécessite Signal v5 ou version ultérieure.

Analyse de pointe intracellulaire
IntraSpikeAnalysis.sgs (01/19)

IntraSpikeAnalysis.zip

Ce script lancera automatiquement l'exploration d'un fichier de données pour effectuer des mesures à partir de chaque pointe détectée. L'utilisateur définit un niveau seuil au moyen d'un curseur horizontal ; le script trouve ensuite chaque pointe qui traverse ce niveau, avant de procéder aux mesures suivantes:

  • Temps
  • Amplitude de la pointe
  • Temps de montée de 10 % à 90 % de l'amplitude de pointe
  • Demi-largeur
  • Amplitude de pic AHP (après hyperpolarisation)
  • Temps écoulé entre le pic et le creux de l’AHP

Vous pouvez passer en revue chaque pointe afin de vérifier la détection correcte des caractéristiques et prendre les mesures au moyen des boutons correspondants de la barre d'outils. Un fichier texte est ensuite généré, contenant les résultats de la mesure effectuée pour chaque pointe. Une fichier de données, Actions.cfs, est inclus en exemple dans le dossier Data de votre répertoire Signal.

Ce script nécessite Signal v3.10 ou version ultérieure.

Tracé de plan de phase
Phase-plane plot.sgs (05/10)

PhasePlanePlot.zip

Ce script génère un tracé de plan de phase, mettant en rapport la dérivée temporelle de la tension de membrane et la tension de membrane elle-même, dans une vue XY. Le script mesure toutes les pointes sur une plage de temps définie par l'utilisateur. Le tracé s'actualise dynamiquement, l'utilisateur pouvant à tout moment faire glisser les positions de curseur pour mettre à jour l'écran. Un fichier de données, Actions.cfs, est inclus en exemple dans le dossier Data de votre répertoire Signal.

Ce script nécessite Signal v3.10 ou version ultérieure.

Configuration de curseurs pour mesures LTP
CursorSetup.sgs (05/10)

CursorSetup.zip

Ce script offre un exemple de configuration de curseurs actifs visant à trouver la réponse maximale et les positions de pente à 10 % et 90 % de la réponse. Ces valeurs sont ensuite tracées sur des vues XY.

Le script invite l'utilisateur à sélectionner le canal de réponse à mesurer et à positionner les curseurs de façon à marquer la ligne de référence pré-stimulus et la plage temporelle de réponse time avant de configurer les curseurs actifs. Ce script pourra aisément être modifié de façon à inclure d'autres mesures si nécessaire. Une fichier de données, LTP example.cfs, est inclus en exemple dans le fichier .Zip.

Ce script nécessite Signal v3.10 ou version ultérieure.

Mesures automatisées à partir d'états de trame multiples
MeasureFromStates.sgs (08/18)

MeasureFromStates.zip

Ce script est un exemple qui prend une mesure sélectionnée, par exemple des amplitudes de réponse évoquée, à partir d’un canal sélectionné dans un fichier avec des états de trame multiples, et trace les mesures à partir de chaque état sur un canal distinct dans une vue XY. Un exemple de fichier de données (MEP example.cfs) est inclus dans le fichier .zip.

Ce script nécessite Signal v4.11 ou version ultérieure.

Soustraction de valeurs de lissage exponentiel
SubExpFit.sgs (05/10)

SubExpFit.zip

Ce script crée une vue dupliquée d'un fichier de données, applique une courbe de lissage exponentiel entre les positions de curseur définis par l'utilisateur, puis soustrait les valeurs de lissage des données brutes.

Ce script nécessite Signal v3.10 ou version ultérieure.

Auto-moyennage de fichiers par lots
BatchAutoAverage.sgs (05/10)

BatchAutoAverage.zip

Ce script effectue des auto-moyennages à partir de chaque fichier de données placé dans un répertoire désigné. Il crée une nouvelle vue de mémoire qui amalgame toutes les trames des auto-moyennages de chaque fichier de données. Chaque trame de la nouvelle vue de mémoire inclut un commentaire, contenant le nom du fichier de données source et précisant les trames source utilisées pour calculer la moyenne.

Le script présume que tous les fichiers de données du dossier désigné contiennent le même nombre de canaux et sont échantillonnés à la même fréquence.

Soustraction d'une série de trames
SubFrameSeries.sgs (05/10)

SubFrameSeries.zip

Ce script permet à l'utilisateur de soustraire une série de trames d'une autre série dans un fichier de données. Le script présume une configuration de verrouillage de tension standard, c'est-à-dire avec un canal contenant le stimulus et un autre contenant les données de réponse. L'utilisateur entre ensuite une série de trames de destination (depuis desquelles les données seront soustraites) et une série de trames sources (les données à soustraire). Les listes de trames peuvent être entrées selon le format courant, par exemple : "1,2,5" ou "1..15".

Ce script nécessite Signal v2.16 ou version ultérieure.

Grande moyenne
SigGrandAverage.sgs (11/10)

SigGrandAverage.zip

Ce script peut être utilisé pour « construire » une moyenne de vues de mémoire de moyenne de formes d'onde multiples. Sélectionnez les fichiers à ajouter à la grande moyenne en ouvrant une vue de résultat sauvegardée ou en créant une nouvelle vue de mémoire, définie comme la fenêtre « principale » ou en cours. Il vous suffit ensuite de cliquer sur le bouton ADD dans la barre d'outils du script.

Ce script nécessite Signal v2.16 ou version ultérieure.

Capture des événements synaptiques
eventcap6.sgs (10/13)

eventcap6.zip

Ce script est conçu pour détecter et analyser les événements synaptiques spontanés (ou miniatures). Le script commence par analyser et détecter les événements, en utilisant une technique de seuillage par rapport à une amplitude, une croissance d'intensité ou un gabarit de référence. L'utilisateur accepte ou supprime ensuite les événements détectés. Une fois cette procédure terminée, l'utilisateur peut sortir les amplitudes ou les intervalles inter-événement des événements et événements mis en moyenne. Le script peut également servir à conduire des tests de Kolmogorov Smirnov sur les résultats (ou d'ailleurs tout autre tableau de données).

Contribution de Bill Connelly – Consulter la liste des membres du Forum utilisateur

Certains de ces scripts ont été développés par les utilisateurs plutôt que par l'équipe CED. Si vous disposez d'un script que vous aimeriez mettre à la disposition des autres utilisateurs sur cette page, informez-en Tim Bergel. Nous fournissons également des scripts pour Spike2.

Ces scripts sont sauvegardés en tant que fichiers WinZip, myscript.zip, sauf lorsqu'ils sont présentés sous le format signal\scripts\myscript.sgs. Ces fichiers ont été installés avec Signal et signal. réfère au répertoire dans lequel vous avez installé Signal. Voir les résumés en cliquant sur la ligne de description ci-dessous. Vous pouvez alors les télécharger en cliquant sur le nom du fichier ; veuillez vérifier la taille reçue.

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Codes de marchandise
Hardware: 84716070
Software: 85234945
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