ECGTone.zip

Ten skrypt odtwarza dźwięk ’pip’ z DAC 0 interfejsu 1401, gdy zostanie wykryta fala R w kompleksie EKG.

Próbkowanie jest kontrolowane przez pasek narzędzi skrypty, a użytkownik jest proszony o ustawienie kanału EKG, który ma być monitorowany oraz wartości histerezy do detekcji piku fali R. Horyzontalny kursor jest wykorzystywany do ustawienia progu detekcji fali R. Za każdym razem gdy próg zostaje przekroczony skrypt śledzi nadchodzące dane. Gdy zostanie wykryty pik, skrypt czeka aż dane ponownie osiągną wartości poniżej ustawionej histerezy zanim odtworzy dźwięk oznaczający wykrycie fali R.

Ten skrypt wymaga Spike2 v6.00 lub wyższej.

BarDisplay.zip

Ten skrypt to przykład na wyświetlanie on-line, w osobnym oknie, wartości kanału w celu przeprowadzenia eksperymentu ze sprzężeniem zwrotnym siły. Skrypt zwiera procedurę bezczynności, która uaktualnia wyświetlany słupek w odpowiedzi na dane nadchodzące poprzez kanał 1.

Ten skrypt wymaga Spike2 v4.24 lub wyższej.

songan.zip

Rozkład nawoływań pasikoników na dzwięki składowe dokonuje się przy pomocy funkcji analizy serii dzięków Spike2. Uzyskuje się prostą tabelę rezultatów. Otwórz i wyświetl plik danych nawoływań pasikoników przed wykonaniem skryptu.

capas.zip

Skrypt ten umożliwia uzyskanie niektórych parametrów danych potencjału czynnościowego serca (CAP).

Najpierw do użytkownika kierowana jest prośba o wybranie odpowiedniego pliku do analizy oraz o podanie kanału CAP a następnie o umieszczenie poziomego kursora na danych, w ten sposób by przecinał on wszystkie wznoszące się części krzywej pliku danych.

Umożliwia to skryptowi umieszczenie znaczników na tymczasowym kanale zdarzeń za każdym razem kiedy jest lokalizowany CAP. Skrypt następnie podejmuje próbę uzyskania pewnych charakterystycznych parametrów CAP. Wartości te są zapisywane na ekranie.

Do uzyskanych parametrów należy:

• Start potencjału czynnościowego serca
• Czas trwania potencjału czynnościowego serca
• Wartość średnia
• Wartość maksymalna
• Czas maksymalnej wartości
• Gradient krzywej wznoszącej się
• Gradient repolaryzacji
• 30, 50, 60, 90 % czasu repolaryzacji

Użytkownik może kliknąć dane w oknie tekstowym, co spowoduje przesunięcie kursora na pozycję wskazywaną przez wartość zawartą w klikniętym okienku (zrobienie tego jest prostsze od opisu).

rsa3.zip

Skrypt przeznaczony do wykazania arytmii zatoki oddechowej w danych elektromiograficznych.

Jest ładowany plik danych, który zawiera jeden kanał aktywności elektromiograficznej oraz kanał fal ciśnienia. Wartość progowa jest ustawiana na kanale ciśnienia, wyznaczając początek i koniec każdej fali ciśnienia. Dla każdego czasu fali ciśnienia próbkowany jest rytm pracy serca przy określonej częstotliwości a częstotliwości chwilowe są rejestrowane do pliku tekstowego.

eyemove.zip

Ten skrypt pozwala użytkownikowi na rysowanie ruchów oczu w dwóch pozycjach oraz pokazuje w formie graficznej pozycje zatrzymania i ruchów nierównomiernych.

Każdy eksperyment składa się z szeregu prób, w których obiekt doświadczalny jest wystawiony na działanie bodzców wzrokowych, a ruch oczu jest rejestrowany przy pomocy odpowiedniego urządzenia. Aparat ten powinien wysyłać dwa napięcia wyjściowe, proporcjonalne do odchylenia kątowego w kierunku X i Y, które stanowią sygnały wejściowe do urządzenia CED 1401 podłączonego do komputera osobistego, który wykonuje skrypt. Po rozpoczęciu próby skrypt wyświetla w czasie rzeczywistym wykres XY ruchu oczu obiektu eksperymentu. Rejestrowane są punkty zatrzymania oczu oraz ruchy nierównomierne. Zapis tych danych jest prowadzony w pliku rejestru.

Załączamy bardzo prosty plik sekwensera (eyemove.pls), który przesyła wyjściowy sygnał cyfrowy do aparatu wytwarzającego impulsy wzrokowe, dzięki czemu jest uzyskiwana wymagana próba.

Dołączamy program do przeglądania wyników i zapisywania danych w trybie off-line.

Skrypt wymaga urządzenia Power1401, 1401plus lub micro1401. Nie współpracuje ze standardowym urządzeniem 1401. Działa tylko przy wersji 3.xx programu Spike2. Nie obsługuje żadnej wersji 2.

Skinner.zip

Skrypt ten pozwala na rejestrowanie jednego lub więcej parametru danych fizjologicznych w czasie nauki przez szczura naciskania dźwigni w urządzeniu testowym. Czas naciśnięcia każdej dźwigni jest rejestrowany jako zdarzenie (na porcie 0 i 1), natomiast urządzenie 1401 impulsy sygnałów wyjściowych TTL, które powodują uwolnienie granulek karmy jeśli szczur odpowiednio zareaguje. Czas uwalniania karmy jest rejestrowany na kanale zdarzeń2. Można ustawić czas refrakcji, kiedy to szczur nie otrzyma nagrody nawet jeśli naciśnie odpowiednią dźwignię.

Dostępne są trzy badawcze schematy:

1. Nagradzane jest naciśnięcie każdej z dwóch dźwigni (tresura)
2. Nagrodzone jest naciśnięcie lewej dźwigni.
3. Nauczanie przeciwstawne. Naciśnięcie lewej dźwigni jest nagradzane określoną serią podawania pokarmu a następnie nagradzane jest jedynie naciśnięcie tylko prawej dźwigni.

Wymagane oprogramowanie: Spike2 wersja 3 lub wyższa.
Wymagania sprzętowe:
Do nagrywania pojedynczego kanału danych fizjologicznych o wysokim tempie próbkowania (10k do 20kHz) potrzebne jest standardowe urządzenie 1401.
Wielokanałowe nagrywanie przy częstotliwości 10kHz lub wyższej przypadającej na kanał wymaga urządzenia 1401plus Micro1401 lub Power 1401.

chirp.zip

Ten skrypt stymulacji dźwiękowej i rejestracji umożliwia Ci:

• Tworzenie złożonych kształtów fal dźwiękowych, takich jak świergoty, rampy, kombinacje świergotu/rampy, wybuchy szumu, wybuchy tonu i sekwencje bodźców.
• Dodawanie wielu kształtów fal do konfiguracji próbkowania, a następnie odtwarzanie ich za pomocą wyjścia DAC 1401 podczas próbkowania, jako bodźców dźwiękowych.
• Ładowanie do 20 różnych bodźców dźwiękowych w konfiguracji próbkowania (ograniczenie wynikające z pamięci 1401) umożliwiające łatwe przełączanie między wieloma bodźcami.
• Odtwarzanie bodźców zarówno jako pojedynczych impulsów wywoływanych przez naciśnięcie przycisków na pasku Play wave, jak i w sekwencjach kontrolowanych przez skrypt.
• Odtwarzanie bodźców powtarzalnie w stałych odstępach, naprzemiennie lub losowo między dwoma stałymi odstępami, lub w losowych odstępach w określonym zakresie.
• Sterowanie programowalnym atenuatorem CED3505.
• Rejestrowanie fizjologicznych odpowiedzi na te bodźce dźwiękowe i wyświetlanie ich jako wyzwalanych przebiegów lub w trybie przewijania.
• Używanie przykładowej konfiguracji próbkowania, Chirp eg.s2cx, do testów.
• Skrypt ToneCal (dołączony) ułatwia kalibrację intensywności bodźców.

Wymagania sprzętowe:

• Power 1401, Micro1401 mkII, Micro3 lub Micro4 z zakresem ±5V.
• Programowalny atenuator CED3505 (jeśli wymagane jest sterowanie intensywnością bodźców przez skrypt).
• Odpowiedni wzmacniacz audio i głośnik lub słuchawki.

Ten skrypt wymaga Spike2 v8.25 lub wyższej.

AudioStimRecSU.zip

Ten zestaw skryptów pozwala na generowanie akustycznych i/lub wibracyjnych stymulacji na jednym lub dwóch kanałach. Jednocześnie rejestrowana jest na poziomie jednokomórkowym odpowiedź neuronalna i wykonywana jest online analiza wykrytych dyskryminatorem okienkowym spajków.

Skrypty te zostały stworzone do badań nad układem słuchowym i narządem linii nabocznej ryb, ale odpowiednie są do szerokiego zakresu badań nad słuchem kręgowców i owadów.

Dzięki temu pakietowi, generować można akustyczne lub wibracyjne bodźce o znanej intensywności oraz rejestrować wewnątrz- lub zewnątrzkomórkowe odpowiedzi pojedynczych komórek na te bodźce. Dostępne bodźce zawierają impulsy tonowe i symetryczne lub niesymetryczne bursty tonów o częstotliwościach od 1Hz do 10kHz. Możliwe jest również stymulowanie przy pomocy wcześniej zarejestrowanych, dowolnych fal (na przykład zarejestrowanych wcześniej dźwięków) lub wyzwalanie zewnętrznego stymulatora. Skrypt może również generować zdefiniowane wcześniej sekwencje stymulacji o szerokim zakresie częstotliwości i intensywności, by szybko zgromadzić kolekcję odpowiedzi pozwalającą na utworzenie krzywych progu odpowiedzi.

System rejestrujący zawiera wirtualny dyskryminator okienkowy do detekcji spajków. Analiza online nadchodzących danych obejmuje postymulacyjne, interwałowe i fazowe histogramy. Do określenia stopnia zgrania w fazie spajków i fali bodźca wykorzystywana jest statystyka kołowa. Dalsze szczegóły znajdują się w instrukcji użytkownika.

Wymagania systemowe:

Sprzęt:	Micro1401 Mk2 lub wyższej. Atenuator CED3505
Oprogramowanie:	Spike2 v7.11 lub wyższa
Skrypty:	AudioStimRecSU.s2s, SoundCalSU 703.s2s
Konfiguracja próbkowania:	SU.s2c
Sekwencer:	SU4.pls
Inne pliki:	MScaldataSU.txt, SpkcaldataSU.txt, SUSettings.txt
Instrukcje użytkownika:	AudioStimRec SU.pdf, SoundCalSU.pdf, 3505_V2spec.pdf

fish abr release.zip

Pakiet skryptów Spike2 nadaje się do rejestracji odpowiedzi słuchowego pnia mózgu (z ang. auditory brainstem responses; ABR) na impulsy tonowe. Stworzony on został dla badań reakcji ryb na podwodne dźwięki, ale może być równie użyteczny do badań odpowiedzi innych kręgowców, na dźwięki przenoszone w powietrzu.

Skrypt generuje przez DAC0 symetryczne impulsy tonowe z liniową fazą narastania i opadania oraz częstotliwością nośną z zakresu od 5Hz do 10kHz. Użytkownik może ustawić kształt impulsu tonowego, jego polarność (lub wybrać zmieniającą się polarność), szybkość powtarzania bodźca i ilość przebiegów, jaka ma być włączona do średniej. Intensywność bodźca może być ustawiona w krokach co 5dB, w zakresie do 75dB przy pomocy kontrolowanego programowo atenuatora CED. Krzywa kalibracyjna, korygująca zmianę intensywności wraz ze zmianą częstotliwości, stosowana jest automatycznie.

Wstępnie wzmocnione odpowiedzi neuronalne, rejestrowane przez ADC0, przetwarzane są przez uśrednianie sygnału. Średnie odpowiedzi dla każdej częstotliwości bodźca, wyświetlane są w kolejności malejącej intensywności bodźca, co ułatwia oszacowania progów. W miarę postępowania eksperymentu, skrypt tworzy i wyświetla krzywą zależności odpowiedzi od progu.

Wymagania systemowe:

Sprzęt:	Power1401 lub Micro1401 Mk2. Atenuator CED3505
Oprogramowanie:	Spike2 v8.00 lub wyższa
Skrypty:	FishABR v1.20.s2s, SoundCalSU v703.s2s
Konfiguracja próbkowania:	Fishabr v1.15.s2cx, SU.s2cx
Sekwencer:	Fishabr v1.15a.pls, SU7.pls
Inne pliki:	MScaldataSU_0.txt, SpkcaldataSU_0.txt, abrsettings.txt
Instrukcje użytkownika:	Fishabr v1.16.pdf, SoundCalSU7.pdf

psf.zip

Okołostymulacyjne wykresy częstotliwości (PSF), histogramy okołostymulacyjne (PSTH) i wykresy CUSUM mogą być wykorzystane do zbadania przebiegu zmian w synaptycznych sygnałach wejściowych do neuronów ruchowych. Metoda ta polega na rejestrowaniu aktywności pojedynczej jednostki ruchowej za pomocą elektrod wszczepianych do mięśnia, podczas powtarzających się stymulacji nerwu czuciowego generujących wejście synaptyczne do motoneuronów.

W oparciu o kanał Event, Marker lub WaveMark z zawierający aktywność jednostki ruchowej oraz kanał Event z zaznaczonymi stymulacjami wejścia sensorycznego, ten skrypt umożliwia generowanie wykresów PSTH, CUSUM i PSF w trybie on-line lub off-line. Możesz również odtworzyć istniejący plik danych, aby symulować nagrywanie online w celach demonstracyjnych.

Skrypt zawiera szczegółowy podręcznik użytkownika i listę odnośników do odpowiednich artykułów.

Skrypt wymaga Spike2 w wersji 8.13a lub wyższej.